周楚的到来打破了司马勋速战速决的美梦，战事胶着在成都附近，虽然司马勋完成了对成都的包围，但是由于周楚坚决抵抗，使司马勋一时半会的拿不下成都来，而桓豁又在向司马勋的老巢南郑进军，这让司马勋不得不又分一部分兵力回援南郑，所以蜀地的局势算是暂时的稳定了下来。
蜀地的局势虽然稳定了下来，但是却让桓温增援广固城的计划落空，受司马勋叛乱的影响，桓温暂时只能优先解决蜀地的问题，所以救援广固城的任务就交给了新任命的青州刺史桓冲，桓冲从合肥出发前往广固，最快也得两个月的时间，时间上可能来不及，所以桓温急令上一任青州刺史荀羡立即前往广固城增援，但是荀羡对桓温罢免了他的青州刺史一职而耿耿于怀，所以故意拖慢了救援的脚步。
广固城被慕容恪围困了十个月，慕容恪也不着急破城，而是选择了筑高墙，挖深壕，用来坚守包围圈，甚至连连砍柴的小路也被切断。而城内早已粮尽，甚至发生了人吃人的惨状，段龛眼见援兵迟迟未到，心一横，决定死一搏，调动全部兵力出城战斗，结果被慕容恪在包围圈内就打败了。
在段龛率军出城之时，慕容恪就事先分派了骑兵趁机控制了各个城门，段龛经过拼死力战，才得以逃回城内，出城的士兵全部覆没。从此城里的士兵与老百姓皆情绪沮丧，再也没有了固守的斗志。
突围又突不出去，援军又迟迟未到，心高气傲的段龛终于熬不住了，他决定出城投降，在被慕容恪围困了十一个月后，段龛打开城门，同时将自己的两手反绑于身后出城投降，他和之前投降于自己的前燕旧将朱秃一起被押解送往前燕都城蓟城。
慕容恪进城后并没有搞大屠杀，而是尽心抚慰城内的百姓，又尽力安置新近归附的民众，在全部平定段齐政权的辖地之后，新任青州刺史桓冲也率军抵达了琅琊郡，慕容恪担任打不过桓温，于在便将段齐政府境内的三千多户鲜卑族、匈奴族、羯族人迁徙到都城蓟城，同时留下镇南将军慕容尘镇守广固城。
前燕皇帝慕容俊处死了叛将朱秃，将段龛任命为伏顺将军，至此，段齐政权正式灭亡，升平元年六月，前燕皇帝慕容俊背信弃义，将段龛杀死后，又活埋了他的部众三千多人，段部鲜卑全族被灭，从此彻底退出了历史舞台。
在帝国西南蜀地、东北齐地皆有战事的时候，西北的又传来了不好的消息，久居西北的前凉政权一直都奉东晋为正朔，但是现在却被前秦所逼，被迫背叛东晋，向前秦称臣，这是自晋武帝司马炎开国以来从未有过的事情，甚至在石勒石虎时代都不曾有过，这让本就焦头烂额的桓温更加的气急败坏，大骂前凉国主张祚是畜生，猪狗不如。
张祚本没有机会继承大位，但是因为在弟弟张重华去世后，张重华的儿子张耀灵年纪尚幼，张祚便勾结内侍赵长、尉缉等人，修改张重华的遗命，当上了辅政大臣，后又与张重华的母亲，也就是自己的后母马氏通奸，马氏被张祚搞的神魂颠倒，于是便下令废自己的亲孙子张耀灵为凉宁候，立张祚为前凉国主，其实到了这里也就可以了，自己也得到了权力，该收手了，可张祚却一不作二不休，直接派心腹杨秋胡在东花园将张耀灵杀害，然后埋在沙坑里，要知道，张耀灵可是他的亲侄子啊，勾引自己的后母，杀害自己的亲侄，这能是人干的事嘛？
这还不算完，在张祚即位之后，更加残暴不仁，他自称大都督、大将军、凉州牧、凉公。而后又与自己亲弟弟张重华的老婆裴氏通奸，这还不算，从宫中的妃妾，再到张骏、张重华没出嫁的女儿，无不奸淫，要知道，张骏可是他父亲啊，张骏的女儿就是他的亲妹妹，他连亲妹妹都不放过，在南朝宋前废帝刘子业没有出生之前，张骏绝对称得上古代乱伦第一人。
张祚的倒行逆施连国人都看不过眼去，纷纷吟诵《墙茨》之诗讽刺他。《墙茨》是《诗经》里的一首诗，讲的是春秋时卫宣公劫娶了自己儿子的聘妻齐女宣姜后不久，他就死了。但是卫宣公的庶长子公子顽见宣姜美丽动人，风姿犹存，不禁也动了淫念，也与宣姜私通起来，生下了齐子、戴公、文公、宋桓夫人、许穆夫人。但纸是包不住火的。不久，这些宫廷秽闻就传到宫外，为国人所知。当时有人感于宫闱中的荒淫无耻，腐化乱伦，便作此诗加以讽刺。
诗中所讲“墙上蒺藜爬， 不可埽也，不可扫掉它。”其实是一种反语，墙上种茨，本是为了防闲内外的，明明公子顽和宣姜私通的事已传至宫外，但作诗人偏偏说墙茨不可扫除，宫闱秘事不可乱传，这是反语。这样写，其实就是揶揄和讽刺二人。
不但如此，张祚还在赵长、尉缉等人的蛊惑下，僭号称帝，设立宗庙，跳八佾之舞，设置百官，当然，张祚知道自己几斤几两，所以称帝也是秘密的，对外依然自称凉州刺史，只是自己关起屋来过过皇帝瘾罢了。
张祚做的最错误的事情就是排挤走了大将王擢，王擢原本是后赵将领，常年与前凉大将张瓘征战，互有胜负，所以二人过节很深，后赵灭亡后，王擢先投降东晋，后又投降前燕，再后来又投降了前凉，前凉国主张重华很重视他，任命他为秦州刺史，这引起了大将张瓘的不满，便秘密支持张祚上位，但是没想到张祚如此下作，这让张瓘实在羞于与他为伍，便自行领兵去守枹罕郡去了。
张瓘走后，张祚更加的排挤王擢，甚至要发兵攻打他，王擢没有办法，只得投降了前秦，赶走了王擢之后，张祚又觉得张瓘太过强盛，对他的统治是个隐患，于是便又派兵攻打张瓘，张瓘忍不可忍，起兵反击张祚，国人早就受够了张祚的倒行逆施，于是便纷纷起兵响应张瓘，张瓘反攻到姑臧城之后，辅国将军宋混在城内起兵响应，张祚被乱军所杀，张瓘攻入城后，立张重华的另一个儿子张玄靓为国主。
前凉的混乱让前秦皇帝苻生看到了机会，他决定趁前凉国主张玄靓年幼之际，派遣征东参军阎负、梁殊出使前凉，引诱前凉向前秦称臣，同时，前秦的秦州刺史、晋王苻柳也写信威慑前凉，同时发兵河西走廊，威胁前凉的东部边境重镇金城郡，鉴于前秦的强盛，此时掌控前凉政权的张瓘十分惧怕，于是遣使向前秦称臣，同时宣布断绝与东晋的来往，这让前秦皇帝苻生十分满意。
此事传到东晋国内，朝野震动，再加上司马勋叛乱，段齐覆灭，同时前燕政权又出兵威胁刚刚收复的洛阳城，一时之间，帝国边境从东到西皆有战事，而此时穆帝刚刚亲政，血气方刚，他认为这都是桓温刚愎自用所致，于是便降旨训诉了桓温，桓温也是有苦说不出，从理论上讲，确实是他的责任，因为桓温是大将军、大司马、太尉，都督中外诸军事，现在国家有难，边境战事四起，不训斥你训斥谁？